• Отдел научно-информационных исследований в таможенном деле
• Отдел исследования экономических и правовых проблем в таможенном деле
• Отдел исследования проблем в теории и практике таможенного контроля, товарной номенклатуры, экспертизы и торговых ограничений
• Отдел исследования таможенных проблем развития евразийской интеграции