• Библиотечно-информационный центр
• Автотранспортный отдел
• Административно-хозяйственный отдел
• Врачебный здравпункт
• Жилищно-бытовой отдел
• Редакционно-издательский отдел
• Контрольно-ревизионный отдел
• Отдел методического обеспечения образовательного процесса
• Организационно-аналитический отдел
• Отдел подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре
• Отдел бухгалтерского учета и контроля
• Отдел защиты гос. тайны и спец. документальной связи
• Отдел профилактики правонарушений и социально-психологической работы
• Отдел кадров
• Отдел культурно-просветительной работы
• Отдел международного сотрудничества
• Отдел менеджмента качества образования, лицензирования и аккредитации
• Отдел обеспечения деятельности УМО высших учебных заведений Российской Федерации по образованию в области таможенного дела
• Отдел капитального ремонта и строительства
• Отдел системного администрирования и защиты информации
• Отдел планирования, координации и ведения научной работы
• Отдел по работе с филиалами и иностранными обучающимися
• Отдел контрактной службы
• Отдел связи
• Отдел эксплуатации тепловых установок
• Отдел эксплуатации энергосистем
• Отделение приемной комиссии
• Учебный отдел
• Финансово-экономический отдел
• Отдел применения комплекса средств автоматизации УСАЦ
• Отдел охраны труда и гражданской обороны
• Учебно-методическая лаборатория информационно-образовательных технологий ОМООП